Sleuth kit というフォレンジックツールを使うとよさそうです。Autopsy という別ツールを組み合わせれば web ベース GUI が利用できます。
対象ファイルシステムは: NTFS, FAT, UFS1, UFS2, EXT2FS, EXT3FS, ISO9660 です。
Windows 系ファイルシステムや CD などメディアのデータ復旧にも使えるのがいいですね。
なお, FreeBSD ports は sysutils/sleuthkit, sysutils/autopsy にあります。
参考:
http://www.gentoo.org/news/ja/gmn/20080728-newsletter.xml