dcmcrle: codificar arquivo DICOM para a sintaxe de transferência RLE

SINOPSE

dcmcrle [options] dcmfile-in dcmfile-out

DESCRIÇÃO

O aplicativo dcmcrle lê uma imagem DICOM não comprimida (dcmfile-in), realiza a compressão RLE (ou seja, a conversão para uma sintaxe de transferência DICOM encapsulada) e grava a imagem convertida em um arquivo de saída (dcmfile-out).

PARÂMETROS

dcmfile-in   DICOM input filename to be converted ("-" for stdin)

dcmfile-out  DICOM output filename ("-" for stdout)

OPÇÕES

opções gerais

-h --help: exibe este texto de ajuda e sai
--version: exibe as informações de versão e sai
--arguments: exibe os argumentos de linha de comando expandidos
-q --quiet: modo silencioso, não exibe avisos nem erros
-v --verbose: modo detalhado, exibe os detalhes do processamento
-d --debug: modo de depuração, exibe informações de depuração
-ll --log-level [l]evel: string constant: (fatal, error, warn, info, debug, trace) usa o nível l para o logger
-lc --log-config [f]ilename: string: usa o arquivo de configuração f para o logger

opções de entrada

+f --read-file: lê o formato de arquivo ou o conjunto de dados (padrão)
+fo --read-file-only: lê somente o formato de arquivo
-f --read-dataset: lê o conjunto de dados sem as informações meta do arquivo. sintaxe de transferência de entrada:
-t= --read-xfer-auto: usa o reconhecimento de TS (padrão)
-td --read-xfer-detect: ignora a TS especificada no cabeçalho meta do arquivo
-te --read-xfer-little: lê com a TS explicit VR little endian
-tb --read-xfer-big: lê com a TS explicit VR big endian
-ti --read-xfer-implicit: lê com a TS implicit VR little endian

opções de codificação de dados de pixel encapsulados

+ff --fragment-per-frame: codifica cada quadro como um único fragmento (padrão)
+fs --fragment-size [s]ize: integer: limita o tamanho do fragmento a s quilobytes (não padrão). codificação da tabela de deslocamento básica:
+ot --offset-table-create: cria a tabela de deslocamento (padrão)
-ot --offset-table-empty: deixa a tabela de deslocamento vazia. SOP Class UID:
+cd --class-default: mantém o SOP Class UID (padrão)
+cs --class-sc: converte para Secondary Capture Image (implica --uid-always). SOP Instance UID:
+un --uid-never: nunca atribui um novo UID (padrão)
+ua --uid-always: sempre atribui um novo UID

opções de saída

+u --enable-new-vr: habilita o suporte a novos VRs (UN/UT) (padrão)
-u --disable-new-vr: desabilita o suporte a novos VRs, converte para OB. codificação do comprimento de grupo:
+g= --group-length-recalc: recalcula os comprimentos de grupo, se presentes (padrão)
+g --group-length-create: sempre grava com elementos de comprimento de grupo
-g --group-length-remove: sempre grava sem elementos de comprimento de grupo. codificação de comprimento em sequências e itens:
+e --length-explicit: grava com comprimentos explícitos (padrão)
-e --length-undefined: grava com comprimentos indefinidos. preenchimento final do conjunto de dados:
-p= --padding-retain: não altera o preenchimento (padrão)
-p --padding-off: sem preenchimento
+p --padding-create [f]ile-pad [i]tem-pad: integer: alinha o arquivo em um múltiplo de f bytes e os itens em um múltiplo de i bytes

NOTAS

O aplicativo dcmcrle comprime imagens DICOM de todas as classes SOP. Ele processa todos os elementos Pixel Data (7fe0,0010) do conjunto de dados, ou seja, a compressão também é realizada em uma imagem de ícone.

Observe que o padrão DICOM não permite armazenar os dados de pixel com múltiplos fragmentos por quadro (quando a compressão RLE é usada). Portanto, limitar o tamanho do fragmento com a opção –fragment-size (ou +fs) pode resultar em uma imagem DICOM não compatível com o padrão.

SINTAXES DE TRANSFERÊNCIA

O dcmcrle oferece suporte às seguintes sintaxes de transferência para a entrada (dcmfile-in):

LittleEndianImplicitTransferSyntax             1.2.840.10008.1.2
LittleEndianExplicitTransferSyntax             1.2.840.10008.1.2.1
DeflatedExplicitVRLittleEndianTransferSyntax   1.2.840.10008.1.2.1.99 (*)
BigEndianExplicitTransferSyntax                1.2.840.10008.1.2.2

(*) se compilado com suporte a zlib habilitado

O dcmcrle oferece suporte às seguintes sintaxes de transferência para a saída (dcmfile-out):

RLELosslessTransferSyntax                      1.2.840.10008.1.2.5

REGISTRO DE LOG

O nível de detalhamento do log das diversas ferramentas de linha de comando e das bibliotecas subjacentes pode ser especificado pelo usuário. Por padrão, apenas erros e avisos são gravados no fluxo de erro padrão. Ao usar a opção –verbose, mensagens informativas, como detalhes do processamento, também são relatadas. A opção –debug pode ser usada para obter mais detalhes sobre a atividade interna, por exemplo, para fins de depuração. Outros níveis de log podem ser selecionados com a opção –log-level. No modo –quiet, apenas erros fatais são relatados. Nesses casos de erro muito graves, o aplicativo normalmente é encerrado. Para mais detalhes sobre os diferentes níveis de log, consulte a documentação do módulo "oflog".

Caso a saída do log deva ser gravada em arquivo (opcionalmente com rotação de arquivo de log), no syslog (Unix) ou no log de eventos (Windows), pode-se usar a opção –log-config. Esse arquivo de configuração também permite direcionar apenas determinadas mensagens para um fluxo de saída específico e filtrar certas mensagens com base no módulo ou aplicativo em que são geradas. Um arquivo de configuração de exemplo é fornecido em < etcdir>/logger.cfg.

LINHA DE COMANDO

Todas as ferramentas de linha de comando usam a seguinte notação para os parâmetros: colchetes delimitam valores opcionais (0-1), reticências no final indicam que múltiplos valores são permitidos (1-n), e a combinação dos dois significa de 0 a n valores.

As opções de linha de comando se distinguem dos parâmetros por um sinal '+' ou '-' à frente. Normalmente, a ordem e a posição das opções de linha de comando são arbitrárias (ou seja, podem aparecer em qualquer lugar). No entanto, se as opções forem mutuamente exclusivas, é usada a ocorrência mais à direita. Esse comportamento está em conformidade com as regras de avaliação padrão dos shells Unix comuns.

Além disso, um ou mais arquivos de comando podem ser especificados usando um sinal '@' como prefixo do nome do arquivo (por exemplo, @command.txt). Esse argumento de comando é substituído pelo conteúdo do arquivo de texto correspondente (múltiplos espaços em branco são tratados como um único separador, a menos que apareçam entre duas aspas) antes de qualquer avaliação posterior. Observe que um arquivo de comando não pode conter outro arquivo de comando. Essa abordagem simples, mas eficaz, permite agrupar combinações comuns de opções/parâmetros e evita linhas de comando longas e confusas (um exemplo é fornecido no arquivo < datadir>/dumppat.txt).

AMBIENTE

O aplicativo dcmcrle tenta carregar os dicionários de dados DICOM especificados na variável de ambiente DCMDICTPATH. Por padrão, ou seja, se a variável de ambiente DCMDICTPATH não estiver definida, o arquivo < datadir>/dicom.dic será carregado, a menos que o dicionário esteja embutido no aplicativo (padrão para o Windows).

É preferível manter o comportamento padrão e usar a variável de ambiente DCMDICTPATH apenas quando dicionários de dados alternativos forem necessários. A variável de ambiente DCMDICTPATH tem o mesmo formato da variável PATH dos shells Unix, em que dois-pontos (":") separam as entradas. Em sistemas Windows, um ponto e vírgula (";") é usado como separador. O código do dicionário de dados tenta carregar cada arquivo especificado na variável de ambiente DCMDICTPATH. Ocorre um erro se nenhum dicionário de dados puder ser carregado.

VEJA TAMBÉM

dcmdrle(1)