dcmmkcrv: ajouter des données de courbe 2D à une image

SYNOPSIS

dcmmkcrv [options] dcmfile-in curvedata-in dcmfile-out

DESCRIPTION

L'utilitaire dcmmkcrv permet de créer des images DICOM contenant des données de courbe. Les données de courbe étant aujourd'hui à peine utilisées par les fournisseurs, cet outil est destiné à tester les implémentations capables de lire des données de courbe. L'utilitaire lit une image DICOM existante ainsi qu'un fichier texte contenant les données de courbe sous forme textuelle. Un groupe répétitif de données de courbe DICOM est créé selon les options spécifiées sur la ligne de commande, ajouté à l'image existante, puis réécrit dans le fichier de sortie. Le fichier de sortie est encodé avec la même syntaxe de transfert que celle utilisée pour le fichier d'entrée. Cet utilitaire ne prend en charge que la création de courbes bidimensionnelles.

PARAMÈTRES

dcmfile-in    DICOM input image file ("-" for stdin)

curvedata-in  curve data input file (text)

dcmfile-out   DICOM output filename ("-" for stdout)

OPTIONS

options générales

-h --help: affiche cette aide et quitte
--version: affiche les informations de version et quitte
--arguments: affiche les arguments de ligne de commande développés
-q --quiet: mode silencieux, n'affiche ni avertissements ni erreurs
-v --verbose: mode détaillé, affiche les détails du traitement
-d --debug: mode débogage, affiche les informations de débogage
-ll --log-level [l]evel: string constant: (fatal, error, warn, info, debug, trace) utilise le niveau l pour la journalisation
-lc --log-config [f]ilename: string: utilise le fichier de configuration f pour la journalisation

options de création de courbe

-r --poly: crée en tant que courbe POLY (par défaut)
+r --roi: crée en tant que courbe ROI. représentation de la valeur de courbe :
+v --data-vr [n]umber: integer 0..4 (default: 4): sélectionne le VR des données de courbe : 0=US, 1=SS, 2=FL, 3=FD, 4=SL
-c --curve-vr [n]umber: integer 0..2 (default: 0): sélectionne le VR avec lequel l'élément Curve Data est écrit 0=VR selon --data-vr, 1=OB, 2=OW groupe répétitif :
-g --group [n]umber: integer 0..15 (default: 0): sélectionne le groupe répétitif : 0=0x5000, 1=0x5002 etc. description de la courbe :
-l --label s: string: définit Curve Label à s (par défaut : absent)
+d --description s: string: définit Curve Description à s (par défaut : absent)
-a --axis x: string, y: string: définit Axis Units à x\y (par défaut : absent)

NOTES

Syntaxe du fichier de données de courbe

Le fichier de données de courbe doit être un fichier texte ASCII brut contenant des nombres (entiers ou à virgule flottante) constituant les valeurs des coordonnées des points. Les nombres doivent être séparés par des espaces. Aucune vérification ni conversion de la plage de valeurs n'est effectuée. Exemple :

 256.451947    1.000000
 477.689863  128.822080
 128.822080  477.689863
  35.310137  128.822080
 256.451947    1.000000

JOURNALISATION

Le niveau de détail de la journalisation des différents outils en ligne de commande et des bibliothèques sous-jacentes peut être spécifié par l'utilisateur. Par défaut, seules les erreurs et les avertissements sont écrits dans le flux d'erreur standard. L'option –verbose permet également de signaler des messages d'information tels que les détails du traitement. L'option –debug permet d'obtenir plus de détails sur l'activité interne, par exemple à des fins de débogage. L'option –log-level permet de sélectionner d'autres niveaux de journalisation. En mode –quiet, seules les erreurs fatales sont signalées. Dans de tels cas d'erreur très graves, l'application se termine généralement. Pour plus de détails sur les différents niveaux de journalisation, consultez la documentation du module "oflog".

Si la sortie de la journalisation doit être écrite dans un fichier (éventuellement avec rotation des fichiers journaux), vers syslog (Unix) ou le journal des événements (Windows), l'option –log-config peut être utilisée. Ce fichier de configuration permet également de diriger uniquement certains messages vers un flux de sortie particulier et de filtrer certains messages en fonction du module ou de l'application qui les génère. Un exemple de fichier de configuration est fourni dans < etcdir>/logger.cfg.

LIGNE DE COMMANDE

Tous les outils en ligne de commande utilisent la notation suivante pour les paramètres : les crochets entourent les valeurs facultatives (0-1), trois points de suspension à la fin indiquent que plusieurs valeurs sont autorisées (1-n), et la combinaison des deux signifie de 0 à n valeurs.

Les options de la ligne de commande se distinguent des paramètres par un signe '+' ou '-' en tête. En général, l'ordre et la position des options de la ligne de commande sont arbitraires (c'est-à-dire qu'elles peuvent apparaître n'importe où). Toutefois, si des options s'excluent mutuellement, c'est la dernière occurrence, la plus à droite, qui est utilisée. Ce comportement est conforme aux règles d'évaluation standard des shells Unix courants.

De plus, un ou plusieurs fichiers de commandes peuvent être spécifiés en utilisant un signe '@' comme préfixe du nom de fichier (par exemple @command.txt). Un tel argument de commande est remplacé par le contenu du fichier texte correspondant (les espaces multiples sont traités comme un séparateur unique, sauf s'ils apparaissent entre deux guillemets) avant toute évaluation ultérieure. Notez qu'un fichier de commandes ne peut pas contenir un autre fichier de commandes. Cette approche simple mais efficace permet de regrouper des combinaisons courantes d'options/paramètres et évite des lignes de commande longues et peu lisibles (un exemple est fourni dans le fichier < datadir>/dumppat.txt).

ENVIRONNEMENT

L'utilitaire dcmmkcrv tente de charger les dictionnaires de données DICOM spécifiés dans la variable d'environnement DCMDICTPATH. Par défaut, c'est-à-dire si la variable d'environnement DCMDICTPATH n'est pas définie, le fichier < datadir>/dicom.dic est chargé, sauf si le dictionnaire est intégré à l'application (par défaut sous Windows).

Il est préférable de conserver le comportement par défaut et de n'utiliser la variable d'environnement DCMDICTPATH que lorsque des dictionnaires de données alternatifs sont nécessaires. La variable d'environnement DCMDICTPATH a le même format que la variable PATH des shells Unix, en ce sens que les deux-points (":") séparent les entrées. Sur les systèmes Windows, le point-virgule (";") est utilisé comme séparateur. Le code du dictionnaire de données tente de charger chaque fichier spécifié dans la variable d'environnement DCMDICTPATH. C'est une erreur si aucun dictionnaire de données ne peut être chargé.